高产光学纯(R)-乙偶姻工程菌株的构建与发酵工艺优化
马志林1, 陈先锐2, 叶柳健1, 李检秀2, 黄艳燕2, 张云开1, 蒙健宗1     
1. 广西大学生命科学与技术学院, 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广西南宁 530004;
2. 广西科学院, 国家非粮生物质能源工程技术研究中心, 非粮生物质酶解国家重点实验室, 广西生物质工程技术研究中心, 广西生物炼制重点实验室, 广西南宁 530007
摘要: 本研究拟在大肠杆菌中构建光学纯(R)-乙偶姻的合成途径和利用辅酶工程调控NADH/NAD+氧化还原平衡,并对工程菌发酵(R)-乙偶姻进行优化。将来源于Enterobacter cloacae的α-乙酰乳酸合成酶基因budB、α-乙酰乳酸脱羧酶基因budA和来源于Lactobacillus brevis的NADH氧化酶基因noxE进行密码子优化后组成基因簇,构建表达质粒并导入大肠杆菌,进一步优化工程菌的培养基成分和发酵条件,提高(R)-乙偶姻的合成能力。结果表明:获得专一性合成高光学纯(R)-乙偶姻的大肠杆菌工程菌株GXASR,对其发酵条件进行系统优化后,摇瓶发酵的(R)-乙偶姻产量为36.82 g/L,光学纯度达99.1%,发酵罐补料发酵的(R)-乙偶姻产量达到67.65 g/L。在大肠杆菌细胞中过表达外源基因簇budB-budA-noxE能够高效合成光学纯(R)-乙偶姻,经发酵优化后,工程菌的(R)-乙偶姻产量、生产强度和得率均显著提高,为代谢工程改造大肠杆菌生产高光学纯(R)-乙偶姻提供了理论基础。
关键词: 合成生物学    辅酶工程    工程菌株    (R)-乙偶姻    发酵优化    
Construction of High Yield Optically Pure (R) Acetoin Engineering Strain and Optimization of Fermentation Process
MA Zhilin1, CHEN Xianrui2, YE Liujian1, LI Jianxiu2, HUANG Yanyan2, ZHANG Yunkai1, MENG Jianzong1     
1. State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, College of Life Science and Technology, Guangxi University, Nanning, Guangxi, 530004, China;
2. National Engineering Research Center for Non-food Biorefinery, State Key Laboratory of Non-food Biomass and Enzyme Technology, Guangxi Biomass Engineering Technology Research Center, Guangxi Key Laboratory of Biorefinery, Guangxi Academy of Sciences, Nanning, Guangxi, 530007, China
Abstract: The synthetic pathway of optically pure (R) acetoin was constructed and coenzyme engineering was applied to regulate NADH/NAD+ redox equilibrium in Escherichia coli which was used to optimize the fermentation conditions. The gene cluster was constructed by codon-optimizing the α-acetolactate synthase gene budB, α-acetolactate decarboxylase gene budA from Enterobacter cloacae, and NADH oxidase gene noxE from Lactobacillus brevis.The expression plasmids were constructed and introduced into E.coli.The medium components and fermentation conditions of engineered strain were optimized to improve the synthesis ability of (R) acetoin.The results showed that an engineered strain of E.coli with high specific optical purity (R) acetoin GXASR was obtained.After systematic optimization of fermentation conditions, the (R) acetoin yield of shake flask fermentation was 36.82 g/L, the optical purity reached 99.1%.And the yield of (R) acetoin by fed-batch fermentation reached 67.65 g/L.(R) acetoin could be synthesized efficiently by overexpressing the exogenous gene cluster budB-budA-noxE in E.coli cells.After optimization of fermentation, the (R) acetoin yield, production intensity and receiving rate were significantly increased.It provided a theoretical basis for metabolic engineering transformation of E.coli to produce high optically pure (R) acetoin.
Key words: synthetic biology    cofactor engineering    engineering strain    (R) acetoin    fermentation optimization    
0 引言

乙偶姻(Acetoin, AC),化学品名为3-羟基-2-丁酮,又名3-羟基丁酮或甲基乙酰甲醇,具有强烈的奶油、脂肪、黄油样香气,是多种天然食品和发酵食品的重要风味物质。我国标准GB 2760—2014规定乙偶姻为允许使用的食用香料,FEMA安全号是2008[1-3]。而且,乙偶姻作为一种重要的四碳平台化合物,已经被美国能源部指定为优先开发的平台化合物之一,在食品、化工、医药、烟草、化妆品、调酒等行业具有广泛的用途[4-5]。乙偶姻具有(R)-乙偶姻和(S)-乙偶姻两种旋光异构体,单一构型的(R)-乙偶姻在合成高附加值手性药物中间体、化学中间体、液晶材料等方面具有重要应用,因此光学纯(R)-乙偶姻的价值要远远高于混合型乙偶姻[3-4]

目前生产乙偶姻的方法主要为化学合成法[6]和微生物合成法[7-14]。化学合成乙偶姻产品中容易掺杂致癌致病化合物,限制了乙偶姻作为食品香精香料的使用。微生物合成的乙偶姻属于天然香料,其市场价格要远远高于化学合成的产品。自然界能够合成乙偶姻的微生物有很多,如粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)、产酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytaca)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)和部分芽孢杆菌属(Bacillus)等[15-19],但天然菌株往往合成乙偶姻的能力较弱、(R)-乙偶姻光学纯度低或菌株具有致病性,不利于(R)-乙偶姻的微生物发酵生产,导致光学纯(R)-乙偶姻的市场价格居高不下,极大地限制了其发展和应用。

近年来,选育和改造天然微生物合成乙偶姻取得较多的研究成果。Xu等[20]通过诱变筛选得到高产菌株B. subtilis TH-49,以葡萄糖为碳源得到乙偶姻产量46.9 g/L;Sun等[21]利用紫外及LiCl进行复合诱变后筛选得到S.marcescens H32,再以蔗糖为碳源进行补料分批发酵,乙偶姻产量能达到60.5 g/L。诱变育种随机性较高,通过代谢工程手段对细胞合成(R)-乙偶姻进行定向改造逐渐成为研究的主流。Bai等[22]和Lv等[23]分别对菌株S.marcescens进行遗传操作,通过敲除meso-2, 3-丁二醇脱氢酶基因slaC,或过量表达转录调控因子基因slaR,使其具有利用蔗糖生产(R)-乙偶姻的能力,产量分别为21.8 g/L和39.9 g/L;Wang等[24]敲除K.pneumoniae CGMCC 1.6366的2, 3-丁二醇脱氢酶编码基因budC,可阻断菌株将乙偶姻转化为2, 3-丁二醇;进一步敲除乙偶姻脱氢酶编码基因acoABCD,工程菌株利用葡萄糖在补料发酵条件下生产(R)-乙偶姻可达62.3 g/L,光学纯度为98.0%。大肠杆菌Escherichia coli属于非致病菌株,并且其本身不合成乙偶姻,因此有利于定向改造成生产光学纯(R)-乙偶姻的工程菌株。Xiao等[25]E.coli BL21(DE3)中过量表达来自B. subtilis的2, 3-丁二醇脱氢酶基因ydjL (bdhA)和来自Lactobacillus brevis的NADH氧化酶基因noxE,以(2R, 3R)-2, 3-丁二醇为原料进行全细胞催化得到41.8 g/L(R)-乙偶姻,光学纯度为96.0%;Xu等[3]克隆S.marcescensbudRbudAbudB基因以及L. brevis的NADH氧化酶基因,将其导入E. coli DH5α中进行表达,葡萄糖补料分批发酵的(R)-乙偶姻产量为60.3 g/L,光学纯度为97.3%。

在微生物细胞中,α-乙酰乳酸合成酶(α-acetolactate Synthase,AlsS)和α-乙酰乳酸脱羧酶(α-acetolactate Decarboxylase,AlsD)是发酵丙酮酸生成(R)-乙偶姻的两个关键酶。另外,糖酵解和三羧酸循环会产生大量的还原型辅酶NADH,而由丙酮酸到(R)-乙偶姻的合成并没有消耗NADH,因此如果单一增强(R)-乙偶姻的合成会造成NADH累积,细胞将启动各种杂醇杂酸合成途径消耗过量的NADH来实现氧化型辅酶NAD+再生,必然会降低(R)-乙偶姻的合成效率和光学纯度。本研究通过对细胞(R)-乙偶姻代谢途径进行系统分析,利用辅酶工程精确调控异源NADH氧化酶进行合理表达来消耗胞内过量的NADH,使胞内NADH/NAD+氧化还原平衡,从而提高(R)-乙偶姻光学纯度。以大肠杆菌E.coli MG1655为宿主细胞,将来源于E. cloacae的α-乙酰乳酸合成酶基因budB、α-乙酰乳酸脱羧酶基因budA和来源于L. brevis的NADH氧化酶基因noxE的核苷酸序列进行密码子优化,利用人工合成的方法获得包含3个基因的基因簇,构建表达质粒pTrc99A-budB-budA-noxE并导入大肠杆菌获得工程菌株,达到提高目标产物转化率和维持胞内NADH/NAD+氧化还原平衡的双重目的,进一步优化工程菌的培养基成分和发酵条件。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 菌株及载体

宿主菌株E.coli MG1655和表达载体pTrc99A由作者所在实验室保藏。

1.1.2 试剂

T4 DNA连接酶和各种限制性内切酶(NEB);质粒提取试剂盒、凝胶回收试剂盒和DNA纯化试剂盒(Promega);蛋白胨和酵母粉(OXOID,分析纯);葡萄糖、氯化钠(分析纯)、乙腈(国药集团化学试剂有限公司,HPLC级别);乙酸乙酯(成都市科龙化工试剂厂,分析纯);乙偶姻(>98.0%)和2, 3-丁二醇(>97.0%)(TCA);氨苄(Amp, 北京索莱宝科技有限公司);甜菜碱(阿拉丁公司);维生素B1(生工生物工程(上海)股份有限公司)。

1.1.3 仪器

恒温水浴摇床ZWY-110X50(上海智城分析仪器制造有限公司), 生物传感分析仪SBA-40D(山东省科学院生物研究所), 3 L发酵罐(上海保兴生物设备工程有限公司), 旋转蒸发器RE-5000(上海贤德实验仪器有限公司), 气相色谱仪7890A(安捷伦科技有限公司), 紫外可见光分光光度计DU800(美国贝克曼库尔特公司), MIKRO 200离心机(德国Hettich科学仪器公司)。

1.1.4 培养基

种子培养基(LB培养基):酵母粉5 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠10 g/L,pH值调至7.0,转化子培养时添加氨苄0.1 g/L,固体培养基另加20 g/L琼脂粉。

初始发酵培养基:葡萄糖80 g/L,酵母粉7 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠0.5 g/L,氨苄0.1 g/L,甜菜碱4 mmol/L,维生素B1 0.1 g/L,pH值调至7.0。

1.2 方法 1.2.1 产(R)-乙偶姻工程菌株的构建

将来源于E. cloacae的α-乙酰乳酸合成酶基因budB、α-乙酰乳酸脱羧酶基因budA和来源于L. brevis的NADH氧化酶基因noxE的核苷酸序列进行密码子优化,在每个基因前面添加含核糖体结合位点和间隔序列TAAGGAGGATATACA连接成基因簇budB-budA-noxE,并由苏州金唯智生物科技有限公司进行人工合成,利用酶切位点SacⅠ和BamHⅠ将基因簇budB-budA-noxE插入质粒pTrc99A的启动子后面,获得多顺反子重组质粒pTrc99A-budB-budA-noxE,再将重组质粒pTrc99A-budB-budA-noxE转化宿主菌E.coli MG1655;以含质粒pTrc99A的E.coli MG1655作为空白对照。分别挑取两种转化子提取质粒进行质粒酶切验证、PCR验证和测序验证。

1.2.2 产(R)-乙偶姻工程菌株的发酵

将验证正确的转化子接到含Amp+的LB液体培养基中,37℃培养12 h,然后分别按照10%的接种量转接于含有50 mL初始发酵培养基的三角瓶(250 mL)中,实验组与对照组各3瓶,37℃,250 r/min,培养36 h。取发酵液,经离心机12 000 r/min离心2 min后,取上清液,经过稀释一定倍数后测残糖浓度以及(R)-乙偶姻含量。其中,(R)-乙偶姻得率为产物(R)-乙偶姻质量与消耗葡萄糖质量之比,生产强度为产物(R)-乙偶姻浓度与发酵周期之比。

1.2.3 产(R)-乙偶姻工程菌株发酵条件的优化

利用摇瓶发酵分别对葡萄糖浓度、酵母粉浓度、蛋白胨浓度、最佳接种量以及最适初始pH值进行单因素实验,优化工程菌株发酵培养基和培养条件。

1.2.4 产(R)-乙偶姻工程菌株发酵罐补料发酵

优化初始发酵培养基后,将菌种接种于3 L发酵罐中,装液量1.5 L,控制通气量1.0 vvm,搅拌转速500 r/min,温度37℃。当残糖浓度为30-40 g/L时补加葡萄糖至150-170 g/L,待发酵至残糖浓度降到5-8 g/L时停止发酵。

1.2.5 残糖浓度的检测

取发酵液12 000 r/min离心处理2 min,取上清液稀释100倍后,用生物传感分析仪SBA-40D检测残糖浓度。

1.2.6 乙偶姻以及2, 3-丁二醇浓度的检测

使用气相色谱仪测定乙偶姻和2, 3-丁二醇的浓度。色谱柱为Phenomenex ZB-WAXplus毛细管色谱柱(30 m×0.32 mm×0.25 μm),进样口温度和检测器温度均为250℃,使用内标法并以乙腈作内标来进行检测。

1.2.7 (R)-乙偶姻光学纯度的测定

采用气相色谱仪测定(R)-乙偶姻的光学纯。色谱柱为Agilent Cyclosil-B毛细管手性柱(30 m×0.32 mm×0.25 μm);FID氢火焰检测器,载气为氮气,流速1.6 mL/min。起始柱温度100℃,保留1 min,然后以10℃/min的速度升温至120℃,以6℃/min的速度升温至130℃,以20℃/min的速度升温至230℃,进样口温度和检测器温度均为240℃,以乙酸乙酯为萃取剂。

2 结果与分析 2.1 产(R)-乙偶姻工程菌株GXASR的构建与发酵

将合成的基因簇budB-budA-noxE亚克隆至表达载体pTrc99A,构建重组质粒pTrc99A-budB-budA-noxE,将重组质粒转化E. coli MG1655,转化子提取质粒进行质粒酶切、PCR条带电泳及DNA测序结果均验证正确,证明工程菌株构建成功,命名为GXASR。同时本研究在各个基因前引入RBS序列来增强与核糖体间的亲和力,提高蛋白翻译效率[26],以此来提高α-乙酰乳酸脱羧酶、α-乙酰乳酸合成酶以及氧化还原酶的表达,调控代谢流,以增加(R)-乙偶姻产量。

将对照菌株与工程菌株GXASR进行摇瓶培养,36 h后发酵结束,对发酵液进行检测,对照菌株发酵液中没有检测到(R)-乙偶姻产生,工程菌株GXASR能够有效地合成(R)-乙偶姻(表 1)。

表 1 工程菌株GXASR在初始培养基中的发酵 Table 1 Fermentation performances of engineering strain GXASR in initial medium
菌种
Strains
残还原糖浓度
Concentration of residual sugar (g/L)
(R)-乙偶姻浓度
Concentration of (R)-Acetoin (g/L)
2, 3-丁二醇浓度
Concentration of 2, 3-BD (g/L)
得率
Yield (g/g)
生产强度
Productivity(g/(L·h))
MG1655/pTrc99A 74.10±0.77 ND ND - -
GXASR 0.00 26.5±0.63 2.49±0.55 0.33 0.73
注:ND表示未检测到
Note:ND means not detected

2.2 产(R)-乙偶姻工程菌株GXASR发酵条件优化 2.2.1 葡萄糖浓度对GXASR工程菌株合成(R)-乙偶姻的影响

工程菌株GXASR在葡萄糖浓度80-120 g/L范围内,随着碳源浓度的升高,(R)-乙偶姻产量也随着提高。但是,随着碳源浓度的升高,培养基变得更加黏稠使得传质效率变低,且较高的碳源浓度,使得菌体所受的渗透压变得更大,不利于菌体生长以及产物的合成。当葡萄糖浓度>100 g/L时,发酵周期明显延长,并且残糖浓度较高,乙偶姻产量提高幅度较小而副产物2, 3-丁二醇浓度提高幅度较大(表 2),从发酵周期、葡萄糖利用程度、乙偶姻产量、副产物生成量以及生产强度综合考虑,将发酵培养基碳源浓度定为100 g/L。

表 2 葡萄糖浓度对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响 Table 2 Effect of glucose concentration on (R)- acetoin produced by engineering strain GXASR
葡萄糖浓度
Concentration of glucose (g/L)
发酵周期
Fermentation time (h)
残还原糖浓度
Concentration of residual sugar (g/L)
(R)-乙偶姻浓度
Concentration of (R)-Acetoin (g/L)
2, 3-丁二醇浓度
Concentration of 2, 3-BD (g/L)
得率
Yield (g/g)
生产强度
Productivity (g/(L·h))
80 36 0.35±0.03 26.10±0.86 2.17±0.34 0.33 0.73
90 38 0.43±0.08 28.44±0.77 2.31±0.25 0.32 0.75
100 40 6.60±0.73 30.49±0.82 3.54±0.46 0.33 0.76
110 48 16.47±0.84 31.16±0.61 9.10±0.38 0.33 0.65
120 54 29.40±0.61 33.24±0.64 12.24±0.77 0.37 0.62

2.2.2 蛋白胨浓度对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响

工程菌株GXASR在蛋白胨浓度为15 g/L时,(R)-乙偶姻浓度、得率、生产强度都达到了最大;当蛋白胨浓度超过15 g/L时,(R)-乙偶姻合成效率反而变低,得率以及生产效率也跟着下降(表 3),这可能是由于蛋白胨浓度不断变高,使得氮源浓度过高导致营养富余,菌体将多余的营养物质用于合成自身所需的其他物质,从而致使(R)-乙偶姻合成效率低下,故将发酵培养基蛋白胨浓度定为15 g/L。

表 3 蛋白胨浓度对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响 Table 3 Effect of peptone concentration on (R)- acetoin produced by engineering strain GXASR
蛋白胨浓度
Concentration of peptone (g/L)
发酵周期
Fermentation time (h)
残还原糖浓度
Concentration of residual sugar (g/L)
(R)-乙偶姻浓度
Concentration of (R)-Acetoin (g/L)
2, 3-丁二醇浓度
Concentration of 2, 3-BD (g/L)
得率
Yield (g/g)
生产强度
Productivity (g/(L·h))
5.0 36 7.73±0.25 28.01±0.26 0.98±0.13 0.30 0.78
7.5 36 6.73±0.43 29.73±0.17 1.21±0.06 0.32 0.83
10.0 36 1.73±0.36 32.41±0.82 1.48±0.22 0.33 0.90
12.5 36 3.67±0.54 33.31±0.61 1.62±0.04 0.35 0.93
15.0 36 6.23±0.61 34.05±0.05 1.56±0.14 0.36 0.95
17.5 36 3.63±0.71 33.48±0.88 1.62±0.25 0.35 0.93
20.0 36 8.97±0.83 31.27±0.34 1.39±0.30 0.34 0.87

2.2.3 酵母粉浓度对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响

酵母粉浓度为15 g/L时,(R)-乙偶姻浓度、得率和生产强度最高;随着酵母粉浓度继续增大,3项指标都略有下降(表 4),这是由于菌株将富余的营养物质以及能量用于副产物的合成,从而降低(R)-乙偶姻合成效率,因此将发酵培养基酵母粉浓度定为15 g/L。

表 4 酵母粉浓度对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响 Table 4 Effect of yeast extract concentration on (R)- acetoin produced by engineering strain GXASR
酵母粉浓度
Concentration of yeast extract (g/L)
发酵周期
Fermentation time (h)
残还原糖浓度
Concentration of residual sugar (g/L)
(R)-乙偶姻浓度
Concentration of (R)-Acetoin (g/L)
2, 3-丁二醇浓度
Concentration of 2, 3-BD (g/L)
得率
Yield (g/g)
生产强度
Productivity (g/(L·h))
5.0 36 7.45±0.32 30.74±0.58 1.91±0.03 0.31 0.85
7.5 36 1.70±0.53 32.68±0.83 2.71±0.21 0.33 0.90
10.0 36 2.83±0.66 33.00±0.80 2.43±0.33 0.34 0.92
12.5 36 2.55±0.82 34.36±0.24 2.86±0.54 0.37 0.95
15.0 36 0.20±0.10 35.51±0.33 2.85±0.18 0.38 0.99
17.5 36 3.77±0.75 35.13±0.22 2.52±0.39 0.37 0.98
20.0 36 0.27±0.16 35.01±0.67 3.11±0.26 0.35 0.97

2.2.4 发酵初始pH值以及接种量对工程菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响

pH值为6.0-7.5时,工程菌株耗糖效率均比较好,残糖浓度小于10 g/L,当pH值为6.5时,菌株的(R)-乙偶姻产量最高(图 1)。首先菌株在pH值为7.0的种子培养基中培养后,转接到pH值为6.5的发酵培养基中,由于pH值相近,菌种很容易适应pH值的变化;其次菌种在发酵过程中会产生有机酸,培养基会呈现弱酸性的趋势,选择pH值为6.5的发酵条件,在发酵过程中不需要补加过多的碱以维持培养基呈中性,减少了碱液对发酵过程的影响。接种量为10%时菌株耗糖效率最快、(R)-乙偶姻产量最高。接种量过低,菌种增殖速度慢,(R)-乙偶姻产量不理想;而接种量过高,菌种增殖速度快,细胞生长额外消耗了较多的碳源,导致用于合成(R)-乙偶姻的葡萄糖减少,故(R)-乙偶姻不升反降(图 2)。因此,确定菌种最适发酵培养基pH值为6.5,最适接种量为10%。在优化的条件下摇瓶发酵(R)-乙偶姻产量为36.82 g/L,光学纯为99.1%。

图 1 初始pH值对菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响 Fig. 1 Effect of initial pH value on (R)-acetoin produced by GXASR

图 2 接种量对菌株GXASR合成(R)-乙偶姻的影响 Fig. 2 Effect of inoculate volume on (R)-acetoin produced by GXASR

2.3 工程菌株GXASR发酵罐补料发酵

经过发酵条件的优化,确定以100 g/L葡萄糖为碳源、15 g/L蛋白胨和15 g/L酵母粉为氮源的发酵培养基,pH值为6.5以及接种量10%进行3 L发酵罐补料发酵实验。在发酵过程中的不同时间点进行取样,检测发酵液菌体浓度、(R)-乙偶姻浓度、2, 3-丁二醇浓度以及残糖浓度。当残糖浓度降至30-40 g/L时一次补加葡萄糖至160 g/L。发酵初期菌体OD600增长迅速,耗糖较快,发酵7.5 h时残糖浓度降低到40.2 g/L,菌体OD600达17.4,此时菌体浓度高、代谢活力强,通过补加葡萄糖,细胞可以高效合成(R)-乙偶姻,发酵液中(R)-乙偶姻浓度快速升高。发酵36 h时,残糖浓度降至8.5 g/L,发酵液中(R)-乙偶姻浓度不再增加,发酵结束,(R)-乙偶姻产量达到67.65 g/L,生产强度为1.88 g/(L·h),得率为0.40 g/g(图 3)。

图 3 工程菌株GXASR补料发酵 Fig. 3 The fed-batch fermentation of engineering strain GXASR

3 讨论

化学法及天然菌种产生的乙偶姻都是(R)-乙偶姻和(S)-乙偶姻的混合物,两者的物理化学性质相近,手性拆分十分困难,存在高成本、高能耗、污染严重等问题,极大地限制了光学纯(R)-乙偶姻开发和应用。因此,开展微生物代谢网络改造及高效生产光学纯(R)-乙偶姻的研究具有重要的意义,也是近年来研究热点之一。Kochius等[27]利用酶催化氧化meso-2, 3-丁二醇的方法合成(R)-乙偶姻,浓度为48 mmol/L,反应需要的辅酶NAD+由电化学方法再生;2016年,Guo等[28]E.coli BL21(DE3)中表达meso-2, 3丁二醇脱氢酶、NADH氧化酶和血红蛋白的基因,将获得的E.coli/pET-mbdh-nox-vgb作为全细胞生物催化剂,可以高效催化meso-2, 3丁二醇还原为(R)-乙偶姻,(R)-乙偶姻的产量为86.7 g/L,光学纯度为97.9%。但全细胞催化法需要采用meso-2, 3-丁二醇、(R, R)-2, 3-丁二醇等作为底物,光学纯的底物成本高昂,无法应用于工业生产(R)-乙偶姻。有相当多的报道[3, 22-25]通过合成生物学方法和代谢工程方法在微生物细胞中高效表达(R)-乙偶姻合成的关键酶基因或敲除(R)-乙偶姻降解的相关基因,对菌株进行代谢网络改造,采用葡萄糖、蔗糖等碳源合成(R)-乙偶姻,其产量和光学纯度都有较大的提高。但是工程菌株中代谢网络的碳架物质流量往往会发生重大改变,导致(R)-乙偶姻合成与细胞内氧化还原平衡关系的失调,进而限制(R)-乙偶姻产量和光学纯度的进一步提高,(R)-乙偶姻光学纯度通常在98%以下。大肠杆菌遗传背景清晰、转化效率高、遗传操作技术成熟,使其在代谢工程等研究领域备受青睐,是用于构建微生物细胞工厂合成生物基化学品首选宿主之一。本研究以大肠杆菌E.coli MG1655为宿主细胞,将来源于E. cloacae的α-乙酰乳酸合成酶基因budB、α-乙酰乳酸脱羧酶基因budA和来源于L. brevis的NADH氧化酶基因noxE组成基因簇,构建大肠杆菌生产(R)-乙偶姻工程菌株,实现大肠杆菌高效合成(R)-乙偶姻和胞内NADH/NAD+氧化还原平衡,通过优化发酵过程,经摇瓶发酵的(R)-乙偶姻产量为36.82 g/L,光学纯度高达99.1%,发酵罐补料发酵的(R)-乙偶姻产量达到67.65 g/L,生产强度为1.88 g/(L·h),得率为0.40 g/g,发酵周期短,生产强度高,是具有潜力的(R)-乙偶姻生产方法。

同时在研究中发现,以葡萄糖、酵母粉和蛋白胨等作为原料时成本仍较高,在大规模发酵生产时不利于提高效益;发酵过程中随着(R)-乙偶姻的积累,会出现2, 3-丁二醇、乙醇、乳酸、乙酸等副产物的产出,副产物浓度升高时会降低目的产物的转化率并导致生物毒性,对菌体的生长速率、菌体浓度以及外源基因表达都会产生明显的抑制作用。本研究下一步将探讨利用廉价原料替代高价碳源氮源,并通过代谢工程、基因组学等手段对细胞内(R)-乙偶姻的合成和分解代谢网络进行系统解析与优化,为低成本、高效率生产高光学纯(R)-乙偶姻提供操作性良好的技术支持。

4 结论

本研究成功构建了产光学纯(R)-乙偶姻的大肠杆菌工程菌株GXASR,并通过摇瓶发酵对发酵培养基和培养条件进行优化,使得工程菌株GXASR能高效地合成(R)-乙偶姻。GXASR工程菌株在优化后的培养基以及发酵条件中,经摇瓶发酵的(R)-乙偶姻产量为36.82 g/L,通过发酵罐补料发酵36 h,(R)-乙偶姻产量能够达到67.65 g/L,光学纯为99.1%,生产强度为1.88 g/(L·h),得率为0.40 g/g,显著提高了(R)-乙偶姻合成效率。本研究为人工途径合成(R)-乙偶姻提供了现实指导意义。

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